Методы исследования в медицинской бактериологии
.pdf141
испытуемой суточной бульонной культуры наносят на МПА и шпателем распределяют по поверхности агара. Затем чашку условно делят на квадраты. В каждый квадрат наносят по капле суспензий разных бактериофагов. После суточного культивирования в термостате учитывают результаты. При соответствии бактерий и фага обнаруживаются зоны лизиса (рисунок 146).
Рисунок 146 – Фаготипирование бактерий по методу Фишера. Заимствовано из Интернет-ресурсов.
Метод Фюрта используется для типирования нескольких неизвестных бактерий с помощью одного известного бактериофага. При выполнении этого теста в расплавленный и остуженный до 45-50ОС МПА добавляют суспензию известного бактериофага и тщательно перемешивают. Полученную смесь разливают в чашки Петри. Каждую чашку условно делят на несколько секторов, в которые высевают штрихом разные исследуемые культуры. Чашки инкубируют в термостате, после чего учитывают результаты. Рост культуры будет отсутствовать в том секторе, в котором бактерии и фаг соответствуют друг другу (рисунок 147).
Рисунок 147 – Фагоидентификация бактерий по методу Фюрта. Заимствовано из Интернет-ресурсов.
Фаготипирование часто используют для выявления источника и путей распространения инфекции (эпидемиологическое маркирование). При этом
142
выделение бактерий одного фаговара от разных больных указывает на общий источник их заражения.
Присутствие каких-либо микроорганизмов в исследуемой пробе (вода, пищевые продукты) можно установить с помощью бактериофагов. Этот прием основан на специфичности действия бактериофагов: бактериофаг E. coli лизирует только кишечную палочку, холерный бактериофаг вызывает лизис только холерного вибриона и т. д. Для установления присутствия определенных бактерий в исследуемую пробу добавляют известное количество специфического фага. При наличии гомологичных бактерий фаг размножается, в результате чего нарастает его титр (количество). Следовательно, реакция нарастания титра фага основана на увеличении количества фага при его контакте с возбудителем непосредственно в исследуемом материале. Реакцию нарастания титра фага используют при диагностике дизентерии и брюшного тифа, для выявления бактерионосительства при брюшном тифе, для обнаружения брюшнотифозных и дизентерийных бактерий
вводе и молоке, для обнаружения дизентерийных микробов на предметах внешней среды, для выявления чумного микроба и холерного вибриона в воде.
Реакция нарастания титра фага проводится следующим образом. К исследуемому материалу добавляется определенное количество индикаторного бактериофага. Смесь инкубируют при температуре 37ОС в течение 4,5-16 часов. Затем пробу прогревают при температуре 58ОС в течение 30 минут и определяют количество (титр) бактериофага методом агаровых слоев по Грациа. Для этого в чашку Петри наливают слой МПА. После застывания на этот слой наливают 2 мл расплавленного и охлажденного до 45ОС полужидкого (0,7%) агара, в который предварительно добавляют каплю бактериальной суспензии и определенный объем суспензии бактериофага. После застывания верхнего слоя агара чашку инкубируют
втермостате при температуре 37ОС в течение 18-24 часов (рисунок 148).
Рисунок 148 – Определение количества фаговых частиц методом агаровых слоев по Грациа. Заимствовано из Интернет-ресурсов.
143
Бактерии размножаются внутри верхнего слоя агара, образуя сплошной непрозрачный фон, на котором хорошо видны негативные колонии фага в виде стерильных пятен. Считается, что каждая негативная колония образуется за счет размножения одной фаговой частицы. Метод Грациа позволяет рассчитывать концентрацию (титр) фага в исходной суспензии (рисунок 149).
Рисунок 149 – Негативные колонии бактериофага в агаре. Заимствовано из Интернет-ресурсов.
Количества фаговых частиц выражают в бляшкообразующих единицах (БОЕ/мл). Титр фага в исходной суспензии рассчитывают по формуле:
N = y/vx,
где: N - титр фага;
y - количество негативных колоний;
v - объем использованного фильтрата фага; х - разведение суспензии фага.
Например, если 0,1 мл фильтрата фага в разведении 10-5 образует 250 негативных колоний, то титр равен 250:0,1 x 10-5 = 2,5 x 108 БОЕ/мл.
144
7. Определение чувствительности бактерий к антибиотикам
Определение чувствительности бактерий к антибиотикам проводят согласно утвержденным документам (стандартам или приказам), которые регламентируют процедуру определения антибиотикорезистентности микроорганизмов. В Российской Федерации существуют соответствующие методические указания по определению антибиотикорезистентности (МУК 4.2.1890-04. Определение чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам. Методические указания), в США и Европе – стандарты и рекомендации Института клинических и лабораторных стандартов (Clinical and Laboratory Standards Institute – CLSI, до 2005 г. - National Committee for Clinical Laboratory Standards - NCCLS). В
Российской Федерации большую исследовательскую и образовательную работу по вопросам клинической микробиологии и антимикробной резистентности осуществляет Межрегиональная ассоциация по клинической микробиологии и антимикробной терапии (МАКМАХ).
Определение чувствительности микроорганизмов к антибиотикам показано в следующих случаях:
-выявление чувствительности бактерий к новому антибиотику, рекомендованному к применению;
-периодический мониторинг распространения антибиотикорезистентности в отдельных регионах;
-обоснование адекватной антибиотикотерапии у некоторых пациентов (при выделении бактерий из первично стерильных тканей и органов, при изоляции возбудителей, резистентных к используемым антибиотикам, при отсутствии опыта лечения новых инфекций).
При тестировании чувствительности микроорганизмов к антибиотикам используют чистую культуру бактерий. Определение чувствительности без выделения чистой культуры возможно только в исключительных случаях. При этом исследование повторяют после выделения чистой культуры бактерий.
При изучении чувствительности бактерий к антибиотикам используют следующие специфические термины.
Минимальная ингибирующая или минимальная подавляющая концентрация (МИК или МПК) - наименьшая концентрация антибиотика, которая подавляет видимый рост исследуемого микроорганизма in vitro (в жидких или на плотных питательных средах) в стандартных условиях постановки опыта. МПК выражается в мкг/мл (мг/л) или ед/мл.
Минимальная бактерицидная концентрация (МБК) - наименьшая концентрация антибиотика, которая при исследовании in vitro вызывает гибель 99,9% микроорганизмов от исходного уровня в течение определённого периода времени.
Чувствительный микроорганизм – это микроорганизм, который не имеет механизмов резистентности к данному антибиотику. Его рост на питательной среде прекращается при использовании антибиотика в терапевтической дозе.
Умеренно-резистентный (умеренно-устойчивый) микроорганизм - это микроорганизм, рост которого на питательной среде прекращается только при использовании антибиотика в повышенной дозе. Лечение инфекций, вызываемых
145
умеренно-резистентными микроорганизмами, в случае отсутствия альтернативных препаратов, проводится высшей (максимальной терапевтической) дозой антибиотика.
Резистентный (устойчивый) микроорганизм - это микроорганизм,
который имеет механизмы резистентности к данному антибиотику. Его рост на питательной среде прекращается лишь при использовании очень высоких концентраций препарата, которые нельзя создать в организме из-за их высокой токсичности. При лечении инфекций, вызванных этим микроорганизмом, клинический эффект от терапии отсутствует даже при использовании высшей дозы антибиотика. При этом могут наблюдаться побочные эффекты от действия антибиотика.
В настоящее время на практике используются следующие методы определения чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам:
-метод серийных разведений антибиотиков в жидких средах;
-метод серийных разведений антибиотиков в плотных средах;
-диффузионный метод классический;
-диско-диффузионный метод;
-комбинированный метод (Е-тест).
Метод серийных разведений в жидких средах предусматривает определение минимальной ингибирующей (подавляющей) рост микроорганизмов концентрации антибиотиков. Для этого готовят 8-12 двукратных серийных разведений антибиотика и суспензию исследуемого микроорганизма с концентрацией микробных клеток 106 КОЕ/мл. В жидкие среды с серийными разведениями антибиотиков вносят исследуемую культуру в соотношении 1:1 (посевная доза – 5·105 КОЕ), инкубируют посевы в течение 10-18 часов при температуре 37°С, и учитывают результаты визуально или нефелометрически. В качестве контроля используют пробирку с питательной средой без антибиотика. МПК соответствует наибольшему разведению препарата, тормозящему рост культуры (рисунок 150).
Концентрацияантибиотика,мкг/мл |
||||||||
|
Концентрация антибиотика, мкг/мл |
|
||||||
32 |
16 |
8 |
4 |
2 |
1 |
00,250,5 |
||
32 |
16 |
8 |
4 |
2 |
1 |
0,5 |
0,25 |
0 |
Рост отсутствует |
Рост бактерий |
Ростотсутствует |
Ростбактерий |
МПК |
|
МПК |
|
Рисунок 150 – Определение МПК методом разведения в жидкой питательной среде.
Иногда в среду культивирования добавляют глюкозу и индикатор, что позволяет учитывать результаты также по изменению окраски среды. Этот метод
146
позволяет установить минимальную ингибирующую концентрацию (МИК) или минимальную подавляющую концентрацию (МПК) препарата для конкретного возбудителя. В качестве питательной среды используют МПБ или другую среду, соответствующую питательным потребностям возбудителя.
Серийные разведения антибиотиков в жидких средах можно проводить микрометодом в лунках планшетов (рисунок 151), используя в планшете один антибиотик и разные культуры или разные антибиотики и одну культуру. Именно этот принцип используется в тех микробиологических анализаторах, которые предусматривают возможность определения чувствительности исследуемой культуры к антибиотикам.
1 |
2 |
3 |
4 |
5 |
6 |
7 |
8 |
9 |
10 |
11 |
Рисунок 151 – Определение чувствительности бактерий к антибиотикам микрометодом серийных разведений в лунках планшета (концентрация антибиотика убывает сверху вниз; 1-11 – номера культур). Заимствовано из Интернет-ресурсов.
Метод серийных разведений в плотных средах аналогичен предыдущей процедуре, но проводится с использованием плотных питательных сред. Для проведения исследований готовят 8-12 серийных двукратных разведений антибиотиков в пробирках, содержащих охлажденную агаровую среду. Содержимое пробирок перемешивают и переносят в чашки Петри до застывания агара. Затем на поверхность агара проводят посев исследуемой культуры в количестве 1-2 мкл (посевная доза 1-2·104 КОЕ). Посевы инкубируют в течение 18-20 часов при температуре 35-37°С. МПК антибиотиков устанавливают по отсутствию роста культуры на агаре с определенной концентрацией антибиотика.
Диффузионные методы менее чувствительны, чем методы стандартных разведений, но проще в исполнении. На практике их применяют чаще. Эти методы являются качественными и позволяют определять чувствительность бактерий к нескольким антибиотикам одновременно.
Классический диффузионный метод осуществляется следующим образом. В чашки Петри вносят тонкий слой (4-5 мм) агара. После застывания на поверхность агара наносят микробную взвесь и равномерно распределяют по поверхности. После подсушивания чашек в термостате в агаре пробивают лунки диаметром 5 мм и в
147
каждую лунку вносят по 0,1 мл раствора исследуемого антибиотика. Чашки инкубируют в термостате при температуре 36ОС в течение 18-24 часов. После культивирования измеряют диаметр зоны подавления роста вокруг лунки для каждого препарата (рисунок 152).
Рисунок 152 – Результат классического диффузионного метода определения чувствительности бактерий к антибиотикам. Заимствовано из Интернет-ресурсов.
Метод бумажных дисков (диско-диффузионный метод, ДДМ) является наиболее распространенным и технически простым полуколичественным методом определения антибиотикочувствительности бактерий. При выполнении этого метода необходимо выполнять некоторые условия: слой агара должен быть 4,0±0,5 мм (в чашку Петри диаметром 90 мм вносят строго 20 мл агара), а поверхность агара – строго горизонтальной.
Для постановки теста готовят суспензию исследуемых бактерий с концентрацией 1,5·108 КОЕ/мл и 1 мл суспензии наносят на чашку Петри с плотной питательной средой. Суспензию распределяют равномерно по поверхности агара, избыток суспензии удаляют, поверхность среды подсушивают и наносят диски с антибиотиками на расстоянии 2 см друг от друга и от края чашки. На одну чашку Петри наносят не более 6 дисков. Посевы с дисками инкубируют при температуре 35ОС в течение 18-24 часов.
Для постановки диско-диффузионного теста используют коммерческие диски размером 6,25 мм в диаметре из специального фильтровального картона. Диски пропитаны антибиотиком в определенной концентрации (рисунок 153).
Рисунок 153 – Диски с антибиотиками для диско-диффузионного метода. Заимствовано из Интернет-ресурсов.
Вокруг дисков чувствительности роста
взависимости от концентрации
Результат
148
антибиотика и задержки
4
Рисунок 154 – Результаты диско-диффузионного метода определения чувствительности бактерий к антибиотикам. Заимствовано из Интернет-ресурсов.
С помощью линейки измеряют диаметры зон задержки роста вокруг дисков и по специальным таблицам определяют степень чувствительности микроба к тому или иному антибиотику (рисунок 155).
Рисунок 155 – Измерение диаметра зоны задержки роста культуры. Заимствовано из Интернет-ресурсов.
За рубежом выпускаются гексадиски (6 объединенных дисков) и октодиски (8 объединенных дисков), позволяющие определять чувствительность бактерий одновременно к 6 или 8 антибиотикам. Для нанесения таких дисков на поверхность агара разработаны специальные диспенсеры (рисунок 156).
149
а б в Рисунок 156 – Диспенсеры (а) для размещения гексадисков (б) и октодисков (в) при
определении чувствительности бактерий к антибиотикам. Заимствовано из Интернет-ресурсов.
Зоны задержки роста культур вокруг дисков измеряют с помощью линейки. Полученные размеры зон сравнивают с величинами зон задержки роста, указанными в инструкции, после чего микроорганизмы относят к той или иной группе (чувствительным, умеренно чувствительным или резистентным). Показатели активности основных антибиотиков, определяемые методом стандартных индикаторных дисков, представлены в таблице 18.
Таблица 18 – Показатели активности основных антибиотиков, определенные методом стандартных индикаторных дисков
№№ |
Антибиотики |
Код |
Содержание |
Диаметр зоны отсутствия роста, мм |
||
пп |
|
диска |
антибиотика в |
устойчивые |
умеренно |
чувстви- |
|
|
(лат.) |
диске, мкг |
|
устойчивые |
тельные |
1. |
Азтреонам |
АТМ |
30 |
≤15 |
16-21 |
≥22 |
|
|
(Ао) |
|
|
|
|
2. |
Амоксициклин |
АКК |
10 |
≤10 |
11-12 |
≥13 |
|
(амоксиклав) |
(Ас) |
|
|
|
|
3. |
Ампициллин |
АМП |
10 |
≤9 |
10-13 |
≥14 |
|
|
(А) |
|
|
|
|
4 |
Бензилпенициллин |
ПЕН |
6 |
≤11 |
12-21 |
≥22 |
|
|
(Р) |
|
|
|
|
5. |
Ванкомицин |
ВА |
30 |
≤14 |
15-16 |
≥17 |
|
|
(Va) |
|
|
|
|
6. |
Гентамицин |
ГЕН |
10 |
≤13 |
- |
≥14 |
|
|
(G) |
|
|
|
|
7. |
Доксициклин |
ДОК |
10 |
≤12 |
13-19 |
≥20 |
|
|
(Do) |
|
|
|
|
8. |
Канамицин |
КАН |
30 |
≤14 |
15-18 |
≥19 |
|
|
(К) |
|
|
|
|
9 |
Карбенициллин |
КАР |
25 |
≤14 |
15-18 |
≥19 |
|
|
(Cb) |
|
|
|
|
10. |
Клиндамицин |
КЛ |
2 |
≤14 |
15-20 |
≥21 |
|
|
(Cd) |
|
|
|
|
11. |
Левомицетин |
ЛЕВ |
30 |
≤14 |
15-18 |
≥19 |
12. |
Линкомицин |
ЛИН |
15 |
≤19 |
20-23 |
≥24 |
|
|
|
|
|
|
150 |
|
|
(L) |
|
|
|
|
13. |
Линезолид |
(Lz) |
30 |
≤20 |
21-22 |
≥23 |
14. |
Меропенем |
МПН |
25 |
≤13 |
14-15 |
≥16 |
|
|
(Mr) |
|
|
|
|
15 |
Метициллин |
МЕТ |
10 |
≤13 |
14-17 |
≥18 |
|
|
(М) |
|
|
|
|
16. |
Мономицин |
МОН |
30 |
≤13 |
14-17 |
≥18 |
17. |
Неомицин |
НЕО |
30 |
≤13 |
14-17 |
≥18 |
|
|
(N) |
|
|
|
|
18. |
Нетилмицин |
НИЦ |
30 |
≤12 |
13-14 |
≥15 |
|
|
(Nt) |
|
|
|
|
19. |
Нитрофурантоин |
(Nf) |
300 |
≤14 |
15-16 |
≥17 |
20. |
Оксациллин |
ОКС |
10 |
≤19 |
20-23 |
≥24 |
|
|
(Ox) |
|
|
|
|
21. |
Олеандомицин |
ОЛЕ |
15 |
≤12 |
13-17 |
≥18 |
|
|
(Ol) |
|
|
|
|
22. |
Офлоксацин |
(Of) |
5 |
≤12 |
13-16 |
≥17 |
23. |
Полимиксин - В |
ПОЛ |
300 ЕД |
≤8 |
9-12 |
≥13 |
|
|
(Pb) |
|
|
|
|
24. |
Ристомицин |
РИС |
30 |
≤9 |
10-11 |
≥12 |
25. |
Рифампицин |
РИФ |
5 |
≤9 |
10-12 |
≥13 |
|
|
(R) |
|
|
|
|
26. |
Стрептомицин |
СТР |
30 |
≤13 |
14-16 |
≥17 |
|
|
(S) |
|
|
|
|
27. |
Тетрациклин |
ТЕТ |
30 |
≤15 |
16-19 |
≥20 |
|
|
(Т) |
|
|
|
|
28. |
Триметоприм |
ТМ |
25 |
≤10 |
11-15 |
≥16 |
|
|
(Nr) |
|
|
|
|
29. |
Триметоприм / |
ТС |
1,25 / 23,75 |
≤10 |
11-15 |
≥16 |
|
сульфаметоксазол |
|
|
|
|
|
30. |
Фузидин |
ФУЗ |
10 |
≤12 |
13-19 |
≥20 |
|
|
(Fc) |
|
|
|
|
31. |
Фуродонин |
ФД |
300 |
≤14 |
15-16 |
≥17 |
|
|
(Fr) |
|
|
|
|
32. |
Цефазолин |
ЦЗ |
30 |
≤14 |
15-17 |
≥18 |
|
|
(Cz) |
|
|
|
|
33. |
Цефалексин |
ЦФЛ |
30 |
≤11 |
12-16 |
≥17 |
34. |
Цефоперазон |
ЦПН |
75 |
≤15 |
16-20 |
≥21 |
|
|
(Cs) |
|
|
|
|
35. |
Цефоперазон / |
ЦПС |
75 / 30 |
≤15 |
16-20 |
≥21 |
|
сульбактам |
(Cfs) |
|
|
|
|
36. |
Цефтазидим / |
(Cac) |
30 / 10 |
≤14 |
15-17 |
≥18 |
|
клавулановая кислота |
|
|
|
|
|
37. |
Эритромицин |
ЭРИ |
15 |
≤14 |
15-18 |
≥19 |
|
|
(Е) |
|
|
|
|
В случае, когда используются антибиотики, не указанные в представленной таблице, используют универсальную оценочную шкалу (таблица 19).
Таблица 19 – Ориентировочная (универсальная) шкала оценки чувствительности микроорганизмов к антибиотикам при использовании диско-
диффузионного метода