- •Оглавление
- •Введение
- •1. Общие принципы организации везикулярного транспорта
- •1.1. Понятие о везикулярном транспорте: определение, его роль в клетке и в организме в целом
- •1.2. Общее представление об основных транспортных путях: биосинтетическом (экзоцитозном) и эндоцитозном. Ретроградный и антероградный транспорт
- •1.3. Основные стадии транспортного процесса
- •1.4. Малые гтфазы, принципы их действия
- •1.5. Формообразование и везикулярный транспорт. Роль липидов и белков
- •1.6. Методологические подходы к изучению везикулярного танспорта
- •2.Характеристика основных транспортных путей
- •2.1. Биосинтетический и экзоцитозный путь
- •2.1.1. Основные компартменты биосинтетического пути: эндоплазматический ретикулум и аппарат Гольджи
- •2.1.2. Прохождение грузов через аппарат Гольджи. Обзор современных гипотез
- •2.1.3. Транс-сеть аппарата Гольджи – основная сортирующая стадия биосинтетического пути
- •2.1.4. Секреторный, или экзоцитозный путь
- •2.2. Эндоцитозный путь. Общая характеристика
- •2.2.1. Пути входа макромолекул в клетку
- •2.2.2. Основные компартменты эндоцитозного пути. Ранние, рециклирующие и поздние эндосомы. Мультивезикулярные тела (мвт). Лизосомы
- •2.2.3. Общие принципы организации эндоцитозного пути
- •2 .2.4. Ранние эндосомы ― главная сортирующая стадия эндоцитозного пути. Возможные механизмы сортировки на путь рециклирования и лизосомной деградации
- •2.2.5. Проблемы идентификации ранних и поздних эндосом. Современные представления об организации эндоцитозного пути. Роль мультивезикулярных эндосом и лизосом
- •3. Формирование транспортных пузырьков
- •3.1. Окаймления и их типы
- •3.2. Сорi окаймление
- •3.3. Copii-окаймление
- •3.4. Клатриновые окаймления. Строение адапторных комплексов семейства ар и gga. Клатрин
- •3.4.1. Сборка gga- и ap1-зависимых окаймлений
- •3.4.2. Сборка aр3 окаймления
- •3.4.3. Aр4 окаймление
- •3.4.4. Сборка и разборка ар2-окаймления
- •3.4.5. Динамин – атипичная гтФаза. Динамин-подобные белки
- •3.4.6. Механизмы сортировки грузов в клатрин-окаймленные ямки
- •3.4.7. Окаймления. Заключение
- •4. Регуляция слияния мембран
- •4.1. Характеристика компонентов системы nsf-snap-snare
- •4.1.1. Принцип действия snare-комплекса
- •4.2.1. Первый цикл после синтеза de novo
- •4.3. Взаимодействие rab-белков и snare в ходе слияния мембран. 3 фазы слияния
- •4.4. Полное слияние и полуслияние (semifusion). Механизм «kiss-and-run». Реорганизация липидных бислоев в процессе слияния
- •4.6. Роль ионов кальция в регуляции слияния
- •5.1. Роль rab-белков в транспортировке грузов
- •6. Липиды и везикулярный транспорт
- •6.1. «Трансмембранная» ассиметрия распределения липидов в мембранах
- •6.2. Латеральная ассиметрия распределения липидов в мембранах
- •6.3. Липиды и формообразование
- •6.4. Фосфатидилинозитиды как регуляторы транспортных процессов
- •6.4.1. Фосфоинозитиды и экзоцитозный путь
- •6.4.2. Фосфоинозитиды на эндоцитозном пути. Механизм действия Vps34
- •6.4.3. Механизм действия фосфорилированых форм PtdIns
- •7. Роль убиквитинирования в регуляции везикулярного транспорта белков
- •7.1. Типы убиквитинирования: моно-, мульти- и полиубиквитинирование
- •7.2. Убиквитин-конъюгирующая система. Деубиквитинирование. Убиквитин-узнающие домены
- •7.3. Убиквитинирование и регуляция эндоцитоза. Убиквитинирование белков-грузов и регуляторных белков
- •7.4. Убиквитин-подобные белки, их роль в транспортных процессах. Связь убиквитин-зависимых механизмов сортировки белков с направлением инвагинации мембраны
- •7.5. Убиквитинирование. Заключение
- •9. Роль цитоскелета в позиционировании органелл и транспортных процессах
- •9.1. Типы цитоскелета, их основные свойства
- •9.2. Цитоскелет и позиционирование органелл
- •9.3. Цитоскелет в транспортных процессах
- •9.3.1. Цитоскелет и транспорт по антероградному пути
- •9.3.2. Цитоскелет и эндоцитозный путь
- •9.3.3. Роль цитоскелета и везикулярного транспорта в обеспечении пигментации кожи и мимикрии
- •10. Везикулярный транспорт в митозных клетках
- •11. Регуляция эндоцитоза рецепторов эфр как пример функционирования транспортной машинерии
- •12. Эндоцитоз и передача сигнала
- •13. Патологии, связанные с нарушением функционирования транспортных систем
- •Заключение
- •Библиографический список
9.2. Цитоскелет и позиционирование органелл
Изучение роли цитоскелета в различных процессах значительно облегчает наличие природных веществ, выделяемых, как правило, из растений, обладающих способностью избирательно деполимеризовать МТ (нокодазол, колхицин, винбластин и др.) или фибриллярный актин (цитохалазины, латринкулин В и т. д.). Практически все ранние работы сделаны с их помощью, и лищь впоследствии были подключены методы молекулярной биологии.
Так, с помощью этих препаратов было показано, что цитоскелет участвует в поддержании постоянной локализации основных органелл в клетке, так называемом позиционировании. В основном это касается взаимного расположения ядра и аппарата Гольжи, который локализован обычно в непосредственной близости от ЦОМТ, а ЦОМТ, в свою очередь, располагается рядом с ядром. В поляризованной клетке, например, движущейся, ЦОМТ перемещается к той стороне ядра, котрая ближе к ведущему краю. Туда же релокализуется и аппарат Гольжди.
Если окрасить клетки млекопитающих антителами к белкам АГ и исследовать их расположение с помощью иммунофлуоресценции, то аппарат Гольджи будет выглядеть как одна или несколько крупных структур, «прилегающих» к ядру ввиде серпа неправильной формы. Если же обработать клетки агентом, разрушающим МТ, то единый АГ «рассыпется» на массу мелких везикул, распределенных по всей цитоплазме. Нет ничего удивительного в том, что после фрагментации АГ его транспортная функция нарушается, и вновь синтезированные белки оказываются не в состоянии пройти необходимые модификации и добраться до пунктов конечного назначения. Однако затем (через 1–2 ч) транспорт и созревание белков восстанавливается, хотя аппарат Гольджи все так же фрагментирован. Электронно-микроскопический анализ показывает, что фрагменты цистерн перераспределяются непосредственно к местам формирования транспортных везикул из ЭПР (так называемых «exit sites), где собираются в функционально полноценные мини-стопки.
Это означает, что МТ сами по себе не отвечают за структурную организацию АГ, но, «стягивая» фрагменты аппарата к ЦОМТ, поддерживают его как единую целостную структуру.
Вполне ожидаемо ведет себя и околоядерное скопление эндосом на позних стадиях эндоцитоза – оно рассыпается и эндосомы не кластеризуются в отсутствие МТ. Эффективность деградации грузов, т. е. взаимодействия с лизосомами, существенно снижается.
Что происходит с аппаратом Гольджи при разборке МФ? Во-первых, сам фибриллярный актин претерпевает коллапс и собирается в агрегаты в области ЦОМТ. Во-вторых, АГ практически «схлопывается», компактизуясь в той же области. Таким образом, МФ в норме «тянут» АГ к периферии. Отмывка цитохалазина приводит к восстановлению нормальных актиновых структур, включая стресс-фибриллы, и восстановлению исходного вида АГ.
Таким образом, локализация органелл – результат баланса между двумя элементами цитоскелета. В значительной степени позиционирование определяется набором и активностью моторных белков.
Наличие некоего моторного белка на мембране органеллы еще не означает ее перемещения в определенном направлении, поскольку с органеллами могут быть связаны как активированные моторы, так и неактивные. В последнем случае они могут работать как якоря, а в активированном – участвовать в транспортных процессах. Хотя АГ не использует МФ в качестве «рельсов», на мембранах аппарата обнаружен моторный белок миозин, который, скорей всего, участвует именно в позиционировании АГ.
Роль промежуточных филаментов изучена довольно слабо, однако известно, что при их отсутствии ядро в клетке начинает вращаться вокруг своей оси, наматывая на себя микротрубочки. Промежуточные филаменты образуют сеть, повторяющую сеть МТ, и участки ПФ могут транспортироваться по МТ в ходе сборки. При деполимеризации МТ ПФ коллапсируют в плотные пучки или кольца вокруг ядра. Оттуда же начинается их восстановление.
Скорее всего, роль промежуточных филаментов сводится к стабилизации взаимодействия МФ и МТ систем, а сами по себе они способны образовывать достаточно жесткую сеть.
