
- •Часть II
- •Содержание
- •Лабораторная работа № 4
- •Ферменты
- •Отличие ферментов от неорганических катализаторов
- •Номенклатура и классификация ферментов
- •Коферменты
- •Свойства и функции коферментов
- •Специфичность ферментов
- •Изоферменты
- •Сравнительное действие ферментов и катализаторов неорганической природы
- •Лабораторная работа № 5
- •Активный центр фермента
- •Молекулярные механизмы ферментативного катализа
- •Мультисубстратные комплексы
- •Количественное определение ферментативной активности
- •Факторы, влияющие на активность ферментов
- •Регуляция каталитической активности ферментов
- •Регуляция путем изменения биосинтеза ферментов
- •Компартментализация ферментов в клетке
- •Лабораторная работа № 6
- •Кинетика ферментативных реакций
- •Уравнение Михаэлиса-Ментен
- •Графическое определение константы Михаэлиса (Кm)
- •Упростив уравнение, получаем:
- •Ингибирование активности ферментов
- •Конкурентное ингибирование аналогами субстрата
- •Графическая оценка констант конкурентного ингибирования
- •Бесконкурентное ингибирование
Графическая оценка констант конкурентного ингибирования
На рис. 6.4 приведен график Лайнуивера-Берка для случая типичного конкурентного ингибирования. Начальную скорость реакции, V0, измеряют при разных значениях концентрации S, но при фиксированной концентрации ингибитора.
Рис. 6.4 |
График Лайнуивера-Берка для случая классического конкурентного ингибирования. +[I] – первая концентрация ингибитора, +2[I] – вторая концентрация ингибитора. Часто начальную скорость реакции обозначают не символом V0, а символом v, как на данном графике. |
Прямые, проведенные через полученные экспериментальные точки, отсекают на оси у один и тот же отрезок. Длина этого отрезка, равна величине l/Vmax. Это означает, что при бесконечно большой концентрации S (1/[S] → 0) Vmax будет такой же, как и в отсутствие ингибитора. Однако длина отрезка, отсекаемого на оси х (эта величина определяет значение КM), в присутствии ингибитора уменьшается (–1/K′M < –1/KM). Следовательно, конкурентный ингибитор увеличивает кажущееся значение КM (К′M) для субстрата. Для простого конкурентного ингибирования длина отрезка, отсекаемого на оси х, будет равна:
Зная величину KM в отсутствие I, из этого уравнения можно определить значение KI. Значения KI, для ряда аналогов субстрата, т.е. конкурентных ингибиторов, показывают, какой из них является наиболее эффективным. Ингибиторы, характеризующиеся наименьшими величинами KI, даже при малых концентрациях могут оказывать сильное ингибирующее действие на активность фермента.
Многие лекарственные препараты, широко использующиеся в клинике, действуют как конкурентные ингибиторы очень важных ферментов, функционирующих как в микробных, так и в животных клетках.
Обратимое неконкурентное ингибирование
Как следует из самого термина – неконкурентного ингибирования, в этом случае конкуренция между S и I за сайт связывания отсутствует. При этом ингибитор обычно ничем не напоминает S и, как можно предполагать, связывается в участке фермента, отличном от активного центра. Обратимые неконкурентные ингибиторы снижают максимальную скорость реакции при данном количестве фермента, но, как правило, не влияют на величину KM. Поскольку I и S связываются с разными центрами, возможно образование как комплекса [EI], так и комплекса [EIS]. Комплекс [EIS] также распадается с образованием продукта, однако с меньшей скоростью, чем при распаде комплекса [ES]; поэтому в присутствии таких ингибиторов реакция замедляется, но не останавливается. Ниже указаны возможные варианты образования комплексов [ES], [EI], [EIS] и пути их распада:
На рис. 6.5 представлена зависимость 1/V0 от 1/[S] в присутствии и в отсутствие ингибитора (предполагается, что связывание I не приводит к существенным изменениям в структуре активного центра).
Рис. 6.5 |
Графическое изображение обратимого неконкурентного ингибирования в координатах Лайнуивера-Берка. –I – ингибитор отсутствует, +I – ингибитор присутствует. Начальная скорость реакции обозначена символом v. |
Необратимое неконкурентное ингибирование
Ферментативная активность может уменьшаться в присутствии многих «ядов», таких, как иодацетамид, ионы тяжелых металлов (Ag+, Hg2+), окисляющие агенты и т.д. В присутствии одного или нескольких субстратов или продуктов скорость инактивации фермента может снижаться. Кинетический анализ, применимый к обратимому неконкурентному ингибированию, о котором шла речь выше, может оказаться неприемлемым для того, чтобы отличить действие ферментных ядов от действия неконкурентных обратимых ингибиторов. Обратимое неконкурентное ингибирование встречается сравнительно редко. К сожалению, оно не всегда выявляется, поскольку и обратимый, и необратимый типы неконкурентного ингибирования характеризуются сходной кинетикой.